Tiene su origen el 16 de junio de 1922, cuando se creó la Escuela de Oficiales Ingenieros. Posteriormente, en 1936, se transformaría en la Escuela de Artillería e Ingenieros. Dada la trascendencia de la ingeniería a nivel global, luego de la segunda guerra mundial cambió su denominación a Escuela Técnica de Ingenieros. Abrió sus puertas a estudiantes civiles en 1972. El 8 de diciembre de 1977 el Congreso Nacional aprueba el cambio de nombre a Escuela Politécnica del Ejército – ESPE. El 26 de junio de 2013, el Consejo de educación superior del Ecuador aprobó la nueva denominación Universidad de las Fuerzas Armadas – ESPE. Unidad Académica Externa IASA II, 17 años. Empezó a funcionar en junio del 2000, en la Hacienda San Antonio, con la carrera de Ingeniería Agropecuaria. El 09 de Marzo de 2016, el Consejo de Educación Superior (CES), aprueba la creación de los Departamentos de Ciencias Exactas, Ciencias de la Computación, Ciencias de la Vida y de la Agricultura. El 06 de Abril de 2016, el CES, aprueba las Carreras de Biotecnología y Tecnologías de la Información, iniciándose como Extensión. El 26 de septiembre de 2016, se coloca la primera piedra en la construcción nuevo campus universitario FASE 1ª.

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